סיפורם של צבי הנינג'ה

הצבים הם כעת בני נוער וגיבורי על בניו יורק. מהר מאוד, הם מוצאים את עצמם ניצודים על ידי בישופ והמכזואידים שלה ונאלצים להתאחד כדי להציל את האנושות.